本动画的主人公是佐藤良太以及他的小伙伴们，故事围绕着五年级小学生看似纯真无邪又充满成人式幽默的日常生活展开。　　良太是个元气十足的男孩子，他爱玩爱闹，最好的朋友是今井浩二和河合翼。在5年2班里，每天都热热闹闹，偷看A书，议论女生，好动而早熟的男孩子们遇上什么事都要大惊小怪一番。与男孩们的好动不同，千佳、有纪这些女孩们显得更加早熟文静，常常对男孩们的幼稚举动感到无语，但在很多时候，女孩们也会在意...

　　故事舞台在21世纪中期的东京，那时东京已经因为温暖化而被密林所覆盖，被骤雨与恐怖的热带蚊所威胁的人们建起了以希腊巨神阿特拉斯命名的高塔移迁到了空中。但是并不是所有的人类都拥有这样的福利，贫困的人们仍然得留在地面与种种危机为邻过着艰辛的生活。摆在刚从少年教养院出来的少女面前的，是一大片危险的密林以及与个性各异的同伴一同参与进以性命做赌注的战斗的命运……...

　　为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。还需要未性别化的“巫女”被派遣担任驾驶员，于是，她们成为了被称为“coru”的战斗小队成员。　　操纵“Simoun”的少数少女被称为了“Simoun·シヴュラ（西贝拉）”因为拥有着特殊能力，她们可以选择自己成为大人的时间。但是因为战争的爆发，她们的...

　　东叶月（能登麻美子配音）爱上了身为同性的初美（清水爱配音），然而，她深爱的人儿却在十六岁生日那天莫名消失了。为了寻找初美，叶月来到了图书馆，在这里，等待着她的是名叫莉莉丝（小林沙苗配音）的图书管理员。莉莉丝告诉叶月，初美的真身其实正是创世始祖夏娃，此时的她正在无数个平行空间里的某一个中生活。　　莉莉丝意外发现叶月的样貌和亚当很像，因此而爱上了她，于是，两人结伴，踏上了寻找初美的旅途。穿越在一个...

　　表面看来，藤原梦路（冈本信彦配音）不过是一介平凡少年，然而，他却隐藏了一个不为人知的的秘密——每天夜晚，他都会遭到噩梦的纠缠，并且，梦路拥有能够预知他人梦境的特殊能力，能够通过观察人们周身所散发出的颜色来判断梦境，尽管准确率很低，但到底算是与众不同。　　某日，梦路惊讶的发现，噩梦中的场景竟然蔓延到了现实之中，正当他处于惊恐之中手足无措时，一位名叫玛利（佐仓绫音配音）的神秘少女出现并救了他，之后...